Яндекс Метрика
cs.LG, stat.ML

Прогнозирование взаимодействия «лекарство-мишень» с использованием графовых нейронных сетей и 3D-структурных представлений

Jaechang Lim, Seongok Ryu, Kyubyong Park, Yo Joong Choe, Jiyeon Ham, Woo Youn Kim17.04.2019

Точное прогнозирование взаимодействия между лекарственным препаратом и мишенью (DTI) критически важно для компьютерного проектирования лекарств. Авторы предлагают новый подход на основе графовых нейронных сетей (GNN), который напрямую учитывает трехмерную структуру комплекса «белок-лиганд». Для повышения точности модели применяется алгоритм графового внимания с учетом расстояний и механизмом гейтинга. В результате предложенный метод превосходит классический докинг и другие алгоритмы глубокого обучения в задачах виртуального скрининга и предсказания конформаций.

Исследование предлагает новый метод прогнозирования взаимодействия лекарств с биологическими мишенями с помощью графовых нейросетей, учитывающих 3D-структуру белковых комплексов. Использование алгоритма внимания с учетом расстояний позволило значительно повысить точность модели, что открывает новые возможности для ускорения компьютерной разработки медикаментов.

Jaechang Lim, Seongok Ryu, Kyubyong Park, Yo Joong Choe, Jiyeon Ham, Woo Youn Kim